美国抗疫日记4月14日:科学家四张图揭示病毒起源

【波士顿双语网2020年4月14日讯】虽然特朗普总统和多个州的州长非常希望尽早重启美国经济,但目前新冠病毒在美国继续蔓延。据美国疾控中心的数据,截止今天,美国已有超过57万人确诊,超过2.2万人死亡。


关于新冠病毒的起源,近来一直是公众关注的焦点。华盛顿大学专攻病毒基因学的生物学家贝德福德(Trevor Bedford)指出,他与西雅图流感研究中心的合作研究表明,美国今年一月份之前没有爆发过新冠疫情。贝德福德4月12日在18条推文中详细阐述了他的研究,其中一条写道:“新型冠状病毒于2020年1月/2月被首次引入美国”。

There is a lot of Twitter chatter surrounding a rumor that circulation of #COVID19 in California in fall 2019 has resulted in herd immunity. This is empirically not the case. COVID-19 was first introduced into the USA in Jan/Feb 2020.

贝德福德在推特上写道:“我们对2020年1月采集的3600个样本进行了新冠病毒检测,结果为零阳性。我们对2020年2月采集的3308个样本进行了检测,在2月21日首次检测出阳性,2月共有10个样本检测出阳性。”

We tested 3600 samples collected in Jan 2020 for COVID-19 status and found zero positives. We tested 3308 samples collected in Feb 2020 and found a first positive on Feb 21 with a total of 10 samples testing positive in Feb. 5/18

早前有一种说法是,新型冠状病毒去年11月已经在美国开始传播,但被外界认为是季节性流感,并且许多美国人感染了这种病毒,因此对疫情已经免疫。Additionally, we confirmed that these samples from acute respiratory infections from Oct 2019 through Feb 2020 contained a variety of different viruses including influenza, RSV, rhinovirus, metapneumovirus and seasonal coronavirus. 6/18

For (2), the genetic relationships among sequenced viruses reveals their transmission history as described here nextstrain.org/help/general/h…. #SARSCoV2 accumulates genetic changes at about 2 per month along a transmission chain (nextstrain.org/ncov/global?l=…). 9/18
There have been hundreds of viruses sequenced from infections in the USA. We can use these sequences to date the arrival of the epidemic. Doing so, we see that there were multiple introductions driving the US epidemic and the earliest was in Jan. nextstrain.org/ncov/global?f_… 11/18

贝德福德表示,新冠病毒起源于美国的这个说法是错误的。该研究从1月开始陆续收集西雅图地区志愿者的病毒样本,最初只是为了追踪流感和其他呼吸道疾病在秋冬季节的传播。近日,流感研究小组对在1月1日至3月10日期间报告有急性呼吸道问题和流感样症状的患者的样本进行了重新检测。

贝德福德还指出,即使回到去年10月,在该地区传播的多种呼吸系统疾病,包括流感、鼻病毒和其他季节性冠状病毒,都与新型冠状病毒“很容易区分”。他写道:“在我们的分析中,这两者之间不可能混淆。从经验上来讲,10月到1月在西雅图的季节性流感不是由新型冠状病毒造成的。”

同时,追踪新冠病毒的传播途径也清楚地表明,这种病毒直到今年1月才进入美国。他写道:“该病毒通过多种途径到达美国。一月下旬有来自中国的直接传入,二月有来自欧洲的疫情的多次传入。”

贝德福德的研究表明,美国的新冠病毒感染率远远低于获得“群体免疫”所需的水平。他表示,最好的解决办法是增加检测,并对感染者和接触过感染者的人群隔离。